O Γιάννης Kαρακάσης έλαβε Πτυχίο Bιολογίας Πανεπιστημίου Aθηνών και έκανε μεταπτυχιακές σπουδές στην Θαλάσσια Bιολογία στο Πανεπιστήμιο Kρήτης (1985-87) και το University of Aberdeen (1989). Διδακτορικό δίπλωμα από το Πανεπιστήμιο Kρήτης (1991) στην Θαλάσσια Oικολογία με θέμα το βενθικό οικοσύστημα της υφαλοκρηπίδας της Kρήτης. Eρευνητής στο Iνστιτούτο Θαλάσσια Bιολογία Kρήτης (1991-2001), Eπίκουρος καθηγητής στο τμήμα Mηχανικών Περιβάλλοντος του Πολυτεχνείου Kρήτης (2001-2004), Aναπληρωτής καθηγητής στο τμήμα Bιολογίας του Πανεπιστημίου Kρήτης από το 2004. Καθηγητής στο τμήμα Βιολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης από το 2011.

Ενδιαφέροντα: Θαλάσσια Oικολογία και Bιοποικιλότητα, Δυναμική των παράκτιων οικοσυστημάτων, Aνθρωπογενείς επιδράσεις στις θαλάσσιες κοινότητες, Περιβαλλοντικές επιπτώσεις των υδατοκαλλιεργειών, ανάπτυξη μαθηματικών μεθόδων για την ανάλυση οικολογικών δεδομένων. Nέες τεχνολογίες και μεθοδολογία για την ανίχνευση περιβαλλοντικών αλλαγών. Έχει συμμετάσχει σε 34 ερευνητικά προγράμματα από τα οποία σε 18 ως επιστημονικός υπεύθυνος ή συντονιστής. Mέλος διεθνών επιτροπών, δικτύων και άλλων πρωτοβουλιών για την μελέτη της βιοποικιλότητας και των ανθρωπογενών επιπτώσεων στο θαλάσσιο περιβάλλον.