Η Ειρήνη Βελισσάρη γεννήθηκε και μεγάλωσε στην Αθήνα. Κατάγεται από τον Σίβα Μεσσαράς Ηρακλείου Κρήτης. Είναι πτυχιούχος του Τμήματος Ιστορίας & Αρχαιολογίας του ΕΚΠΑ (κατεύθυνση Ιστορίας) και του Τμήματος Φιλολογίας του ΕΚΠΑ (κατεύθυνση Κλασικής Φιλολογίας). Στο Τμήμα Φιλολογίας του ΕΚΠΑ πραγματοποίησε τις μεταπτυχιακές της σπουδές με ειδίκευση στη Βυζαντινή Φιλολογία. Το 2025 υποστήριξε δημοσίως τη διδακτορική της διατριβή, η οποία βαθμολογήθηκε ομοφώνως με «Άριστα μετ’ επαίνου» (τίτλος διδακτορικής διατριβής: Η διαμόρφωση της λογοτεχνικής εικόνας του βυζαντινού αυτοκράτορος στις ιστοριογραφικές πηγές του 12ου αι. Συγκριτική αφηγηματολογική μελέτη του προσώπου του αυτοκράτορος). Τα ερευνητικά της ενδιαφέροντα εστιάζονται κυρίως στην πολιτική ιδεολογία και στην κοσμική ιστορία και γραμματεία της Βυζαντινής Αυτοκρατορίας.