Ο Ρομπέρ Μπουαγιέ γεννήθηκε το 1943 στη Νίκαια της Γαλλίας.

Σπούδασε στην École Polytechnique, στην École Nationale des Ponts et Chaussées και στο Ινστιτούτο Πολιτικών Επιστημών του Παρισιού. Το 1978 εξελέγη διευθυντής ερευνών στο Εθνικό Κέντρο Επιστημονικών Ερευνών (CNRS) και το 1982 διευθυντής σπουδών (καθηγητής) στην Ανωτάτη Σχολή Κοινωνικών Επιστημών (EHESS). Από το 1974 έως το 2011 εργάστηκε στο Κέντρο Μελετών Cepremap, όπου δημιουργήθηκε μια κοινότητα επιστημόνων που απαρτιζόταν από τους Michel Aglietta, Jacques Mistral, Jean-Pascal Bé¬nassy, Alain Lipietz και Hugues Bertrand και η οποία διατύπωσε τη «Θεωρία της Ρύθμισης»: δεν μπορούμε να ερμηνεύσουμε τα οικονομικά φαινόμενα επί τη βάσει αφηρημένων και αξιωματικών μοντέλων, αλλά λαμβάνοντας συνδυαστικά υπόψη τα ιστορικά γεγονότα, τους πολιτικούς, νομικούς και πολιτιστικούς θεσμούς, καθώς και τους κοινωνικούς συσχετισμούς και το ιδεολογικό πλαίσιο της δημόσιας δράσης και των ιδιωτικών αποφάσεων.

Στα ελληνικά, έχει κυκλοφορήσει επίσης το βιβλίο του Η θεωρία της ρύθμισης (Εξάντας).