Ο Μανόλης Κούνουπας γεννήθηκε στο Ρέθυμνο. Μητέρα του ήταν η γνωστή στους λογοτεχνικούς κύκλους της Κρήτης λογοτέχνιδα Λέλα Κούνουπα.

Σπούδασε Οδοντιατρική στο Πανεπιστήμιο Αθηνών.

Έχει ασχοληθεί συστηματικά με το χρονογράφημα και το ηθογραφικό διήγημα, ως συνεργάτης στον ημερήσιο και περιοδικό τύπο, καθώς και με φυσιολατρικά και περιβαλλοντικά θέματα, ταξιδιωτικές εντυπώσεις κ.ά.

Το έργο του έχουν σχολιάσει θετικά πολλοί επώνυμοι των Γραμμάτων όπως οι Μαν. Μανούσακας, Κώστας Γεωργουσόπουλος, Γ. Μπαμπινιώτης, Στυλιανός Αλεξίου, Γιάννης Γριντάκης κ.ά.

Βραβεύτηκε από το Σύνδεσμο Φιλολόγων Χανίων σε Παγκρήτιο διαγωνισμό λογοτεχνίας.