Ο Γιάννης Μοσχάκης γεννήθηκε στην Αθήνα το 1958. Τελείωσε το 1976 την Ιωνίδειο Πρότυπο Σχολή Πειραιώς και το 1981 αποφοίτησε από το Μαθηματικό Τμήμα του Πανεπιστημίου Αθηνών. Έκανε μεταπτυχιακές σπουδές στο Παρίσι και είναι κάτοχος DEA στατιστικής (Πανεπιστήμιο Pierre et Marie Curie). Είναι, επίσης, κάτοχος διδακτορικού διπλώματος στα χρηματοοικονομικά μαθηματικά (Πανεπιστήμιο του Bradford Αγγλίας). Εργασίες του έχουν δημοσιευθεί σε έγκριτα ελληνικά και ξένα περιοδικά. Από το 1988 εργάζεται στην Εθνική Στατιστική Υπηρεσία της Ελλάδος.