Ο Ανρί Πιρέν γεννήθηκε το 1862 στο Βερβιέ του Βελγίου. Πήρε το διδακτορικό του από το Πανεπιστήμιο της Λιέγης το 1882 και συνέχισε τις σπουδές του στο Παρίσι, τη Λειψία και το Βερολίνο. Ανάμεσα στα σημαντικότερα έργα του περιλαμβάνεται η επτάτομη "Histoire de la Belgique", η "Histoire de l\'Europe des invasions au XVIe siecle" και το μεθοδολογικό "Reflexion d\'un solitaire". Ανέπτυξε αντιστασιακή δράση εναντίον των Γερμανών κατά τη διάρκεια του Α΄ Παγκοσμίου Πολέμου, για την οποία συνελήφθη και οδηγήθηκε σε στρατόπεδο συγκέντρωσης. Ο Ανρί Πιρέν θεωρείται σήμερα ένας από τους μεγάλους Ευρωπαίους ιστορικούς του 20ού αιώνα, και άσκησε καθοριστική επίδραση στους "πατέρες" των Annales Μαρκ Μπλοκ και Λυσιέν Φεβρ. Η συμβολή του στην ανανέωση των ιστορικών σπουδών, η οποία υπήρξε καίρια και ρηξικέλευθη, απασχόλησε το παγκόσμιο ιστορικό συνέδριο του 1928 στο Όσλο.

Ο Ανρί Πιρέν πέθανε το 1935.