Ο Μανόλης Μανωλεδάκης γεννήθηκε στη Θεσσαλονίκη. Σπούδασε Ιστορία και Αρχαιολογία στη Φιλοσοφική Σχολή του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης και έκανε μεταπτυχιακές σπουδές στην Κλασική Αρχαιολογία. Παρακολούθησε μαθήματα και διαλέξεις στα Πανεπιστήμια της Χαϊδελβέργης και του Βερολίνου και το 2003 έγινε διδάκτορας της Φιλοσοφίας του Τμήματος Ιστορίας-Αρχαιολογίας του Α.Π.Θ.

Από το 1996 εργάστηκε σε διάφορες ανασκαφές (Δίον, Βεργίνα κλπ.) ενώ από το 2000 είναι συνεργάτης της ανασκαφής του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων στη Μινώα Αμοργού. Γνωρίζει αγγλικά και γερμανικά.

Έχει δημοσιεύσει τις μονογραφίες "Νέκυια. Το έργο του Πολύγνωτου στους Δελφούς" 2003 και "Δίκη Πολύποινος. Η απονομή δικαιοσύνης στην αρχαία ελληνική μυθολογία και τέχνη" (2005), και διάφορα άρθρα.

Έχει πάρει μέρος στο διεθνές συνέδριο ελληνικής κεραμικής που έγινε το 2001 στο Κίελο της Γερμανίας, με την ανακοίνωση "Strafendarstellungen auf archaischen attischen Vasen und ihre politische und soziale Dimension".