Η Σίσσυ Παπαθανασίου γεννήθηκε στο Αγρίνιο. Σπούδασε νομικά, θέατρο και κινηματογράφο στην Ελλάδα. Συνέχισε τις σπουδές της στην κοινωνική ανθρωπολογία, την ιστορία πολιτισμών και το θέατρο στο Παρίσι στην Ecole des Hautes Etudes en Sciences Sociales και στο Institut d’ Etudes Theatrales της Σορβόννης.

Καλλιτεχνική διευθύντρια του Φεστιβάλ Θεάτρου "Αναλόγιο" από το 2005. Διετέλεσε υπεύθυνη του προγράμματος "Αναγνώσεις" του Εθνικού Θεάτρου. Το 2018 διορίστηκε προϊσταμένη στη Διεύθυνση Γραμμάτων του Υπουργείου Πολιτισμού.

Δημοσιεύει άρθρα και μελέτες, σκηνοθετεί και μεταφράζει θεατρικά έργα, εισηγείται, παρουσιάζει και επιμελείται την έκδοση λογοτεχνικών κειμένων και εκδόσεων τέχνης. Συμμετέχει με ανακοινώσεις σε διεθνή συνέδρια στην Ελλάδα και το εξωτερικό και σε σεμινάρια για την πολιτιστική διαχείριση, το θέατρο και τη θεατρική γραφή.