Ο Θοδωρής Καραπάντσιος σπούδασε στο Τμήμα Χημικών Μηχανικών του Αριστοτέλειου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης, όπου και εκπόνησε τη διδακτορική του διατριβή μετά από μεταπτυχιακές σπουδές στο τμήμα Χημικών Μηχανικών του Πανεπιστημίου Rochester (Η.Π.Α). Από το 2001 διδάσκει στον τομέα χημικής τεχνολογίας και βιομηχανικής χημείας θέματα χημικής τεχνολογίας με έμφαση σε διεργασίες μεταφοράς θερμότητας και μάζας.