Ο Γιάννης Τσαντούλης σπούδασε στο Τμήμα Πολιτικής Επιστήμης και Δημόσιας Διοίκησης του Πανεπιστημίου Αθηνών και πραγματοποίησε μεταπτυχιακές σπουδές στο ίδιο Τμήμα ("Ευρωπαϊκές και Διεθνείς Σπουδές", 2003-2005), όπου και έλαβε υποτροφία από το ΙΚΥ για τις ακαδημαϊκές του επιδόσεις. Συνέχισε τις μεταπτυχιακές του σπουδές στο Πανεπιστήμιο της Βόννης και από το 2010 είναι υποψήφιος διδάκτωρ στο Πανεπιστήμιο του Λονδίνου (UCL, SSEES). Έχει εργαστεί στο ελληνικό Υπουργείο Εξωτερικών (2004-2005), στο Κέντρο Ευρωπαϊκής Ολοκλήρωσης στη Βόννη (2007) και στο Διεθνές Κέντρο Μελετών Ευξείνου Πόντου (ΔΙΚΕΜΕΠ) στην Αθήνα (2007-2010). Έχει γράψει άρθρα σε ακαδημαϊκές επιθεωρήσεις και περιοδικά καθώς επίσης και κεφάλαια σε συλλογικούς τόμους στην Ελλάδα και στο εξωτερικό.