Η Ελένη Μαρκάκη γεννήθηκε στη Θεσσαλονίκη και ζει στον Βόλο. Σπούδασε πολιτικός μηχανικός στην Πολυτεχνική Σχολή του Aριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης. Εργάσθηκε ως καθηγήτρια σε δημόσια Τεχνική Σχολή στη Θεσσαλονίκη. Ως πολιτικός μηχανικός εργάσθηκε σε τεχνικές υπηρεσίες στην Καβάλα και στον Βόλο. Σήμερα είναι συνεργάτης σε τεχνική εταιρεία.

Έγραψε αρκετά διηγήματα και ένα μυθιστόρημα. Το διήγημά της με τίτλο "Μετρό", περιέχεται στη συλλογή διηγημάτων "Οι γυναίκες μηχανικοί γράφουν", έκδοσης Τεχνικού Επιμελητηρίου Ελλάδος. Διηγήματά της βραβεύθηκαν σε λογοτεχνικούς διαγωνισμούς. Το μυθιστόρημα με τίτλο "Ο κήπος με τα μυστικά" βραβεύθηκε από την Πανελλήνια Ένωση Λογοτεχνών με το Β\' βραβείο Μυθιστορήματος 2009.